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內部審計針對不同的行業和領域表現出特定的審計內容：
對醫療衛生行業
醫療收費監控
在系統中預設醫療收費物價考核指標標準，對醫療收費系統進行實時跟蹤、監督。如果醫療收費系統的處理出現背離相應標準指標的情況，這些數據就會在監控程序中向監督人員發出信號或消息。
醫療設備監控
系統
可以對大型醫療設備的使用情況進行監督, 再結合醫療收費監控，可以對大型醫療設備的收費進行控制，防止醫療設備漏費、私收費現象的發生；同時，方便醫院領導對大型醫療設備的使用及收入情況進行了解。
藥品物價監控
系統中藥品物價實時監控，是通過相關監控程序對庫存系統中日常核算數據進行實時跟蹤、監督來實現的。如果庫存核算系統的處理出現背離監控界限或參數的情況，這些數據就會在監控程序中向監督人員發出信號或消息。
對行政事業單位
預算執行監控
系統具自動讀取預算系統的功能，根據設定的預算項目和財務數據的對應關系，實現財務數據與預算數據、財務指標與預算數據、預算指標的對比分析和穿透式查詢，找出差異的原因，并對預算執行情況進行預警定義，實現多種等級的預警提示。
專項經費監控
通過設定專項經費來源總額和分項金額以及支出總額和分項金額來檢查專項經費的來源和支出的執行情況；檢查收支執行情況是否存在超支現象，檢查專項經費支出是否存在串戶和不規范核算情況。
對制造行業
存貨庫齡監控
通過對原材料、半成品、庫存商品等存貨的庫存業務進行監控，及時反映企業的庫存結構、資金占用、積壓數量、積壓時間，使企業庫存管理人員能及時掌握、調整庫存周轉頻率，盤活積壓資金，既保障庫存物資及時供應生產的需求，又防止過度積壓，提高資金使用效率。
銷售業務的監控
通過對銷售業務的監控，使銷售數據在系統中實時更新，這樣可以及時對銷售的收入、單位成本、單位利潤等銷售數據進行分析，使企業管理人員能及時掌握市場狀況，尤其是同一產品在不同市場的銷售價格等情況，以便做進一步的市場戰略調整。
財務監控
系統中財務系統的時監控，是通過相關監控程序對財務核算系統中日常核算數據進行實時跟蹤、監督來實現的，如果財務核算系統的處理出現背離審計界限或參數的情況，監控程序會自動向審計人員發出預警信號或消息。
財務規范性控制
現金坐支監控：可以根據定義的現金坐支檢查公式進行監控。
異常憑證監控：審計人員可以根據會計制度和內部財務制度的規定自行定義異常憑證中的科目對應關系，憑證發生時系統可以及時提示并記錄這些異常對應關系憑證，并提示這些異常憑證所涉及的內控制度缺陷。
財務分析監控
可以允許設置以及組合財務分析工具提供的方法，定義分析的標準，以及違反標準的結論，形成具體的分析方案，并且每一條分析，可以預先設置其分析結果，通過分析的結果可以發現管理過程中發生的問題。
經濟指標監控
可以通過系統定義好的經濟指標，設置指標數值范圍、指標數值趨勢、指標同比數、指標預算數的控制.
大額收支監控
通過對現金、銀行存款賬戶大額收支監控限額的設定，對收支的金額過大或數量過多時，監控程序會自動向審計人員發出預警信號。
審計作業監控
幫助審計工作人員依照法律規定和企業授權開展審計監督作業，實時監控，及時預警和查處違法違規問題。
重大疑點監控
通過設置疑點分類監控的方法，將在審計作業過程中發現的審計疑點根據重要性原則進行監控提示，幫助審計主管明確審計詳查的方向。
重大違規金額監控
通過設置違規金額分類標準的方法，監控在審計作業過程中查清的違規金額，幫助審計主管根據重要性原則進行監控提示，提示審計主管審計項目在違規金額方面的重大程度。例如：違規金額超過10萬元以上時系統向審計人員發出監控預警信息。
違規問題監控
通過對違規問題設置重要性標準的方法，監控在審計作業過程中違規問題的屬性和重要性，幫助審計主管判別問題嚴重性程度，提示審計主管審計項目在違規問題方面的嚴重程度。例如：違規問題屬于貪污或小金庫等嚴重違法違規時，系統向審計人員發出監控預警信息。
審計作業進度監控
通過對審計作業實際進度和計劃進度進行比較的方法，并設置計劃進度，完成差異監控指標，對審計作業進度進行監控，當出現較大差異時，及時進行監控提示，幫助審計主管及時了解在審計作業中可能存在的問題及嚴重程度。例如：實際進度明顯落后于計劃進度30%時，系統向審計人員發出監控預警信息。
內部審計資料清單
賬務資料
1、審計期間會計報表及附注（含分公司）
說明：含年報主表、附表和報表附注以及季報、月報表
2、全部賬目
說明：內審期間
3、全部會計憑證
說明：內審期間
4、科目余額表
說明：內審期間各年1級至末級的期初、期末和累計發生額
5、銀行存款對賬單、余額調節表
說明：內審期間各年所有帳戶全部銀行存款對賬單和審計期末銀行存款余額調節表
6、房屋、車輛等固定資產及無形資產產權證明（鑒定書）
7、長短期投資，投資協議、被投資單位營業執照、被投資單位會計報表
說明：截止會計報表日的被投資單位經審計會計報表
8、長短期借款合同，抵押擔保資料
說明：內審期間
9、固定資產盤點表
說明：標明固定資產各稱、規格、數量、原值、預計殘值、使用年限、折舊額、凈值
10、存貨盤點表
說明：截止會計報表日的盤點表，標明存貨的名稱、規格、數量、單價、總金額
11、納稅申報表、繳款書、稅務檢查報告
說明：所有稅種內審期間期間各年納稅資料
12、所有往來明細
說明：含應收（付）帳款、預收（付）帳款、其他應收（付）帳款
13、收支明細表
說明：內審期間各年主營業務收支明細、其他業務收支明細
14、費用明細表
說明：內審期間各年管理費用、經營費用、財務費用明細
15、支票的領、用、存及作廢情況表登記簿
說明：內審期間期
16、發票使用情況表
說明：領購票號、金額；已使用的票號、金額；剩余的票號、金額
備 查 類 資 料
17、營業執照
說明：工商
18、稅務登記證
說明：國稅、地稅
19、組織機構代碼證書
說明：質量監督局
20、納稅鑒定文件
說明：國稅、地稅
21、公司章程、協議
說明：工商備案
22、設立、變更驗資報告
23、以前年度審計報告、資產評估報告
說明：內審期間內
